熒光定量分析PCR技術(shù)的特點(diǎn)
PCR技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)
1.操作簡(jiǎn)便
應(yīng)用PCR方法的早期階段操作縈瑣,因?yàn)槭褂玫木酆献硎谴竽c桿菌DNA聚合酶I的大片段,即Klenow片段,而不是耐高溫的TaqDNA聚合酶,而且操作也未實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化。目前使用的是耐高溫的TaqDNA聚合酶,其操作也實(shí)行了電腦控制的DN八擴(kuò)增儀的自動(dòng)化,只要將擴(kuò)增反應(yīng)所需要的特定程序輸入DNA自動(dòng)擴(kuò)增儀,操作臺(tái)PCR操作箱把反應(yīng)所需要的全部材料混合均勻,置入儀器內(nèi),反應(yīng)就會(huì)按照所輸入的正確程序進(jìn)行。如果需要,還可隨時(shí)予以調(diào)整。
2. 省時(shí)
應(yīng)用TaqDNA聚合酶時(shí),單核昔酸摻入的速率較高,75℃一80℃時(shí),每個(gè)酶分子每秒鐘可完成150個(gè)核昔合成.PCR每一周期需數(shù)分種,所以,一般取用20一30個(gè)周期能使目的DNA達(dá)到數(shù)百萬(wàn)倍擴(kuò)增的反應(yīng)只需數(shù)小時(shí)即可完成.在基因分離,突變體構(gòu)建,DNA測(cè)序等方面,PCR方法均較之常規(guī)方法快速得多.例如,乾蕓GENIN PCRroom-1st操作臺(tái)PCR操作箱用常規(guī)方法建立cDNA文庫(kù)或染色體DNA文庫(kù)來(lái)分離基因,需花幾個(gè)月時(shí)間,用PCR方法只要1一2個(gè)周;用M13法構(gòu)建突變體需l一2個(gè)月,用PCR法僅用數(shù)天;PCR方法擴(kuò)增的目的DN段可直接用作測(cè)序分析,較常用的通過(guò)克隆,培養(yǎng)擴(kuò)增,純化制備等步驟獲得測(cè)序片段更為簡(jiǎn)便,省時(shí)。
3.靈教度高
PCR產(chǎn)物的生成,是以指數(shù)方式增加的,所以欲擴(kuò)增pg量級(jí)的起始物到雌水平成放大真核細(xì)胞單拷貝基因,通過(guò)PCR方法都是不難完成的。PCR方法還可用單一雙倍體細(xì)胞,一根頭發(fā),甚至單一精子進(jìn)行DNA定型。
4.特異性強(qiáng)
作為引物的寡聚核昔酸與模板結(jié)合的正確性是決定反應(yīng)產(chǎn)物是否特異的關(guān)鍵。TaqDNA聚合酶耐高溫的性質(zhì),使得反應(yīng)中引物與模板退火的步驟可以在較高的溫度下進(jìn)行,結(jié)合的特異性大大增加,被擴(kuò)增的目的DN段也能保持很高的正確程度。
5.對(duì)原始材料質(zhì)t要求低
由于PCR技術(shù)有高靈敏度和強(qiáng)特異性,故僅含量(Pg,ng水平)的目的DNA的粗制品或者總DNA,就可以作為反應(yīng)起始材料來(lái)獲取目的DNA擴(kuò)增產(chǎn)物。部分的降解的DNA材料也可以通過(guò)PCR多次反應(yīng)周期,最終得到所需的含全長(zhǎng)序列的DN段.用石蠟包埋的組織切片,甚至幾千年前出土的文物,只需經(jīng)過(guò)適當(dāng)?shù)奶幚?,乾蕓GENIN PCRroom-1st操作臺(tái)PCR操作箱都可用PCR技術(shù)進(jìn)行目的DNA的擴(kuò)增,這樣就有可能對(duì)系統(tǒng)保存的病理材料進(jìn)行檢測(cè),解決以前無(wú)法解決的問(wèn)題,同時(shí),這一特性也使PCR技術(shù)應(yīng)用到考古學(xué),人類學(xué)等領(lǐng)域成為可能。
6.PCR技術(shù)應(yīng)用范圍廣
PCR技術(shù)可應(yīng)用于核酸結(jié)構(gòu)和功能研究的各個(gè)領(lǐng)域,如DNA一級(jí)結(jié)構(gòu)的測(cè)定,基因突變,基因工程,蛋白質(zhì)工程及基因治療等各個(gè)方面,都有著重要的應(yīng)用.PCR技術(shù)的出現(xiàn),使這些領(lǐng)域發(fā)生了顯著的變化。
PCR技術(shù)的缺點(diǎn)
1、假陽(yáng)性問(wèn)腸
如果PCR反應(yīng)系統(tǒng)中,既使污染一個(gè)拷貝的DN段,如果和引物結(jié)合以后,經(jīng)過(guò)擴(kuò)增反應(yīng),則判為陽(yáng)性。但這種結(jié)果是一種假陽(yáng)性結(jié)果。因此,反應(yīng)系統(tǒng)中的樣品,試管,移液器及試管要求確實(shí)無(wú)DN段的污染,否則其結(jié)果判定十分困難。
2.單核普酸的錯(cuò)誤接人
由于TaqDNA聚合酶缺乏3"5’核酸外切酶的活性,因而不能糾正反應(yīng)中發(fā)生的錯(cuò)誤的核昔酸摻入;與大腸桿菌DNA聚合酶1的Klenow片段相比,用前者的反應(yīng)發(fā)生錯(cuò)誤摻入的較多.錯(cuò)誤核昔酸摻入的頻率還受反應(yīng)條件的影響,所以對(duì)僅由TaqDNA聚合醛引發(fā)的錯(cuò)誤摻入很難精確估計(jì).TindanK.R.估計(jì)是每9000個(gè)核昔酸摻入中發(fā)生一次錯(cuò)誤,乾蕓GENIN PCRroom-1st操作臺(tái)PCR操作箱而合成41000個(gè)核昔酸可能導(dǎo)致一次框碼移位。但是,這種錯(cuò)誤并不意味著PCR產(chǎn)物一定會(huì)發(fā)生序列改變,InnisM,A.發(fā)現(xiàn),錯(cuò)誤摻入的堿基有終止鏈延伸作用的傾向,這就使得發(fā)生了的錯(cuò)誤不會(huì)再擴(kuò)大。這一點(diǎn)對(duì)PCR結(jié)果有利。
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